隐藏于黑暗的谜之斗士，暗黑兽 水、木、钢之恶斗士被凯路比兽召见。凯路比兽道出钢之恶斗士水银兽隐瞒了塞拉菲兽的资料而使其很恼怒。众人来到黑暗大陆，不安的预感笼罩整块大陆……众人遇到性行温和的蝙蝠兽，但是树兽却立即出现吸收了蝙蝠兽的数据并进化成花瓣龙兽袭击众人。众人进化成兽型迎战，但是花瓣龙兽吃掉森林道理的树木而变得巨大，实力大增，还能自我恢复，五兽对它毫无办法。但众兽团结起来，封锁花瓣龙兽的攻击并用合技将其打倒，最终将抢去木之兽型魂。此时最后一个恶斗士——代表暗的黄昏兽出现了，出乎众人的意料，它竟然一剑将树兽杀死然后面对众兽，一场恶战即将开始！