购物步行街发生的一连串事件，不过是恐怖分子集团制造的烟雾弹。藤丸与“third-i”竭力避免牺牲者的出现，他们都意识到，此次事件只不过是悲剧前的一场序曲。

一心记挂着妹妹遥（川岛海荷）的藤丸赶到医院，却被眼前的情景所惊呆。整个病房中，不见遥的身影，而她的主治医生，京子（宫泽美保）已昏迷。正在藤丸心绪不宁之时，电话突然响起。打来电话的正是捉走遥的男人。他威胁道，“要想救你妹妹，就去侵入third-i的系统。”藤丸终于赶到遥的所在之地，然而这里却被安放了定时炸弹。爆炸时间渐渐逼近，藤丸最终做何选择……

另一方面，third-i本部得到消息，称“一名女性送来了真的病毒”。终于，病毒的魔手偷偷的伸向了普通市民。恐怖分子集团接连不断的设下陷阱。藤丸就读的学校的生物老师，折原玛雅也露出自己的本性来。