施琅率战船于六月十六日到达澎湖，蓝理率领的先锋左营夺得八罩岛泊船港。施琅进军的战船很快在海上形成了多组品字形船队，号炮连天刘国轩拼命抵抗，由于潮汛原因施琅的战船被搁浅，刘国轩命令集中兵力向施琅帅船发起进攻，经众将军的全力拼命反击，施琅解危。首战澎湖海受阻，八罩屿锚地施琅命令将临阵退缩的詹六奇等人推出斩了，吴启爵建议让他们戴罪立功。施琅率战船和水师二万多人屯结在八罩岛，饮水问题已经影响军心的稳定，施琅决定组织一支兵马挖井寻找新水源。当刘国轩还在开庆功会饮酒时候，天空突然打雷，六月一雷止九台，刘国轩大惊，自知完了。