庆源大君突然生病，高烧不退，引起内医院一阵惊慌，而长今坚持婉拒担任中宗的主治医官，闵政浩对长今如此轻易放弃感到遗憾，此时京城已经开始传出痘疮病症，长今深入乞丐的住处，愿意一个人和患有痘疮的小朋友被隔离在茅屋，专心替孩童治病，内医院禀报中宗和皇后，庆源大君的症状正是痘疮，皇后痛哭流涕，亲自出宫找寻长今，此时虽然长今已经治好痘疮的孩童，但是并不知道确切的病因，奉皇后之命回宫之后，与所有内医院医官和医女一心一意同心协力，治疗庆源大君，庆源大君终于康复，完成困难的使命，皇后对长今另眼相看，对过去自己所犯下的错误请求原谅，而中宗也不顾朝廷众臣反弹，执意要任命长今为从六品主簿……