会津公下了命令要除掉芹泽，岁三近藤决定合众人之力杀掉芹泽，龙之介得知此事，竟已来不及告诉大家芹泽的身体问题，最终芹泽被杀，众人亦决意杀死跑丢的龙之介，然而被总司找到的龙之介展示出与其最早截然不同的求生欲，最终被总司推进河里故意放跑。从此新选组在黑暗之后走入了黎明，而变若水的研究转而由山南进行。