两年过去，小龙女将武功尽传给杨过后，欲赶杨过出古墓。没想到，杨过对小龙女不离不弃，让小龙女大为感动，岂料心情一受波动，竟伤及内功经脉。小龙女这才告诉杨过，尚有一套《玉女心经》没有传授于他。为了化解小龙女的伤，杨过决定跟小龙女一起修炼玉女心经。

玉女心经修炼必须在空旷处敞开衣物，小龙女、杨过练功疗伤之际，尹志平、赵志敬意外闯入。赵至敬污蔑小龙女藉口练功，实对杨过动邪念。小龙女激怒异常，却因内功大损无力抵抗。遂命令杨过杀尹志平、赵志敬灭口。尹志平见事于此，竟挥剑自断尾指，发誓日后一定保密。

杨过偕小龙女回古墓，但小龙女已气若游丝，杨过心急如焚。但屋漏偏逢连夜雨，小龙女重伤之际，李莫愁又至。小龙女、杨过威迫在即。小龙女说自己命在旦夕，愿与李莫愁同归于尽，但求杨过出古墓，遂以断龙石阻断出路。岂料杨过依言出古墓，却又折回。四人同困古墓之中、面对死亡。没想到，石棺下竟另有一条出路，小龙女因杨过愿为己赴死，感动不已，待二人重获新生后，决心雨杨过共闯江湖。