使用魔术手法在全世界范围内进行盗窃的大怪盗·怪盗基德，在时隔8年后首次现身。

喜爱魔术的高中生黑羽快斗，在同学的面前发出了要与基德一决胜负并将其逮捕的宣言。当天，基德对正在小野银行中展示的宝石“月之瞳”发出了盗窃预告。回到家中的快斗意外发现了已经去世的魔术师、父亲黑羽盗一留下的密室，房间中不知为何存放着与怪盗基德一模一样的服装。快斗抱着见到基德就会知道些什么的想法前往小野银行，因此知道了盗一之死的真相，以及盗一不为人知的一面……